Khi thực hiện gia công thường sẽ sử dụng tọa độ gia công của người dùng. Do tọa độ gia công của người dùng có thể được định nghĩa lại qua các lệnh G52, G92 hay G54...G59 nên trong một số trường hợp cần sử dụng tọa độ máy (đôi khi gọi là tọa độ tuyệt đối) khi: thay dao tự động, hay khi rút dao về vị trí Home sau khi kết thúc gia công. Về mặt vật lý gốc tọa độ máy trên một máy CNC là cố định trong suốt quá trình gia công.

Đây là các tọa độ do người dùng định nghĩa qua các lệnh G52, G92 hay G54...G59. Mỗi khi định nghĩa lại tọa độ gốc của tọa độ người dùng sẽ được thay đổi và nằm tại một vị trí xác định trong tọa độ máy ở trên.